Kepala Daerah Kota Jayapura tahun 1979 - Sekarang.

Walikota Pertama tahun 1979-1989.

Drs. Florens Imbiri.

Walikota kedua tahun 1989-1993.

Drs. Michael Manufandu, MA.

 

Drs. Michael Manufandu, MA.

Walikotamadya ketiga periode 1994 - 1999.

Drs. R. Roemantyo

Walikota keempat 

Drs. M. R. Kambu, M.Si / Wakil Walikota  J.I Renyaan, SH. periode 2000-2005

Drs. M. R. Kambu, M.Si / Wakil Walikota  J.I Renyaan, SH.

Walikota kelima periode 2005-2010

Drs. M. R. Kambu, M.Si / Wakil Walikota H.Sudjarwo, BE. 

Drs. M. R. Kambu, M.Si / Wakil Walikota H.Sudjarwo, BE.

Walikota keenam 

Drs. Benhur Tomi Mano, MM / Wakil Walikota Dr. H. Nuralam, SE, M.Si.periode 2011- 2016

Drs. Benhur Tomi Mano, MM / Wakil Walikota Dr. H. Nuralam, SE, M.Si.

Penjabat Walikota Jayapura 
 

Daniel Pahabol, S.Pd, MM

 

Walikota Jayapura ketujuh

Dr. Drs. Benhur Tomi Mano, MM / Wakil Walikota  Ir. H. Rustam Saru, MM periode 2017- 2022.